(一)殡葬用地规划严重缺位，成为制约公益性公墓建设的一大核心问题。在绝大多数城市之中，殡葬用地并没有被纳入城乡总体建设规划。经营性公墓用地尚且如此，公益性公墓建设用地的获得更是难上加难。相对城市而言，农村公益性公墓的土地状况也不容乐观。农村土地多已承包到户，集体所有的荒山瘩地尽管存在地区性差异，但总体存量也不多。特别是在经济发达地区，村集体土地多数已对外出租或用于他项建设，没有给公墓建设预留土地。诸如此类，导致公益性公墓建设只能“见缝插针式”地进行，其难度可想而知。
浏家港陵园,上海公墓
(二)专项资金的短缺，是制约公益性公墓建设的另一关键问题。目前，绝大多数地方政府的财政预算中，并没有用于公益性公墓建设的专项资金。即使在民政事务的经费预算中，也难见到公益性公墓建设经费的专项列支。在部分财政发达的地区，相关资金也多是从其他领域挪用。财政经费预算的短缺和不稳定，成为了公益性公墓建设的瓶颈。农村公益性公墓的法人因往往为村委会，与经营性公墓可先行从银行贷款再用于公墓建设和经营不同，公益性公墓只能走“边经营边建设”的道路。由此，公益性公墓违规经营也便司空见惯。有关负责人曾用“既要马儿跑，又不让马儿吃草”来形容当下农村公益性公墓建设现状，形象地点破了当下公益性公墓建设困局。
(三)相关建设标准、规范的缺失，在很大程度上限制了公益性公墓建设进程。在过去相当长的一段时期内，公益性公墓的建设标准是普遍缺失的。一直到了近些年，才有部分省市出台了相关建设标准。比如，湖北、海南、河南、甘肃等少数省份均颁布了松益性公墓建设标准》，但除此之外的大多数省份都没有出台建设标准。且从出台的建设标准来看，各省对公益性公墓的建设条件、建设方式、占地面积等规定也各不相同，这对公益性公墓建设来说显然是不利的。
