影响农村发展生态公墓的原因很多，归纳为以下几方面:
1.政策保障缺失
目前，在农村对于如何建生态公墓、建怎样的生态公墓以及如何管理等缺乏相关法规保障，没有统一机构进行管理，处于各自为政、条块分割的状态，无疑降低了生态公墓在农村发展中各责任主体相互合作的效率。惠民政策存在着覆盖面窄、分布不均、保障率低等问题，特别是城乡之间殡葬服务保障差距较大，自从农村实行家庭联产承包责任制后，对自家承包地有了自由支配权，但长期以来对承包地的用途缺乏最基本的认识。虽然国家对耕地的用途有明确规定，但农民根本不理会土地的性质，农村殡葬管理比较混乱，有关部门明知违法，但缺少执法的依据。
2.资金投入不足
农村公墓作为现代农民安葬亲人的一种特殊需要，会受当地经济发展水平的影响。在经济较发达的东部农村，财政收入雄厚，生态公墓的规划数量和建设水平自然较高。在经济欠发达的中西部地区，生态公墓在农村的发展离不开政府财政资金的支持。在现行的财税制下，地方财政收支状况往往成为制约农村社会保障程度的决定性因素。一些地区政府部门不愿把农村社会保障摆上工作日程的重要位置，就是担心会产生制度性的财政支出压力，致使一些临时性的保障措施上升为政策，规划建设标准偏低，随意性大。应坚持统筹城乡协调投入的同时，探索适应市场化发展需要的多渠道筹资机制。
3.传统观念阻碍
(1)“天人合一”观念的影响。我国具有几千年农耕文化，农民依赖土地生活，对土地有着深厚的感情。因此，土葬被认为是人与自然的最佳融合，农民希望遗体能保存完好地融入土地，所以比较重视墓地的选择和建造，这种观念影响着现代中国丧葬方式。(2)宗教观念的影响。我国传统的殡葬观以儒家、道家、佛家的影响最广。儒家思想在丧葬礼仪上注重“厚葬隆丧”;道教将人的死亡看成是复归自然;佛教讲究“六道轮回”，将火葬引入我国，遵从厚养薄葬的丧葬观。我国传统的殡葬观是多种观念的融合，这些观念影响着现代中国丧葬礼仪。(3)风水观念的影响风水又被称之为“堪舆”，本为相地之术，注重勘察山川地势、讲求天、地、人的和谐统一。认为人死后骨血融入地脉，地脉的吉凶会影响到子孙的祸福。风水理论在墓地的选址上要求地势高，通风好，最好头后有山、脚下有水的地貌形态;在建设墓地时依托当地地形，不破坏周围植被。这种观念影响着现代中国丧葬理念。
4.人口数量制约
人口较多的农村地区，自然死亡人数也会较大，对农村墓地的需求量也会较大，要求农村公墓在建设规模上也会较大。根据2010年11月国家统计局第六次人口普查公告显示:我国人口已达到13.4亿人，其中60岁以上的老年人为1.74亿，约占总人口的12.8%，而65岁及以上人口占到8.87%。预计到2015年，我国60岁以上老年人口将达到2.16亿，约占总人口的16.7%，而届时农村老年人数约为老年人口总数的60%。随着中国农村人口老龄化问题日益严重，丧葬方式对农村经济、环境、社会各方面会产生重大的影响。还有沿海与内地、平川与山区、城郊与远乡等农村地区，由于人口密度的差异，也会影响农村发展生态公墓的进程。
